Нагато Узумаки являлся официальным лидером Акацуки и одним из главных антагонистов. Все члены организации, кроме Конан называли его Лидером. Он управлял действиями организации и был уважаем всеми ими. Позже, стало известно что большую роль в создании и управлении организацией играл так же Тоби, с которым Нагато тесно сотрудничал.
Учиха Мадара — один из отцов-основателей Конохи. Считался одним из сильнейших шиноби мира. К тому же он первый шиноби которому удалось усовершенствовать Мангекё Шаринган. Из-за действий Тоби, совершённых с использованием его имени, иногда трудно определить, что является результатом поступков Мадары, а что - поступков уже Тоби. Известно, что на данный момент они стремятся к реализации общего плана — "Глаз Луны".
Орочимару — один из главных персонажей манги и аниме-сериала «Наруто», созданного Масаши Кишимото. Он — искусный психолог, с лёгкостью убеждающий людей помогать ему и воплощение образа безнравственного учёного.Все последователи Орочимару, за исключением Саске, превозносят и уважают его. Однако сам он относится к своим подчинённым, как к пешкам, заботясь о них лишь ради достижения собственных целей.
Минато Намикадзе — более известен как "Желтая молния Конохи" персонаж манги и аниме Наруто. Четвертый Хокаге Конохи и отец Наруто Узумаки. Тот, кто запечатал в Наруто девятихвостого лиса.
Бакуретсучу (爆裂虫, "Взрыв насекомых") — Ниндзюцу, которое используют члены Нокизару Шу. После того как пользователь ослепляет противника дымовой завесой, тот, сам того не замечая, при дыхании поглощает личинки, которые скрещиваются в одно существо в его теле. Это существо начинает расти и спустя определенное время взрывается. Тем не менее его можно удалить простой операцией.
Хирайшин но Дзюцу (飛雷神の術, "Техника летающего бога грома") — разработанная Йондайме Хокаге техника, при которой пользователь двигается невероятно быстро от одного места к другому.
Кучиёсе: Ирон Майден (口寄せ・哀暗冥電, "Призыв: Стальная ловушка") — Ниндзюцу Морино Ибики, с помощью которого он призывает большого стального кота, который захватывает противника. Затем этого кота связывают цепи и уносят под землю вместе с оппонентом.
Кучиёсе: Гомон Хейа (口寄せ・拷問部屋, "Призыв: Камера пыток") — Дзюцу Морино Ибики, с помощью которого он способен пытать жертву и выяснять необходимую информацию.
